Forskare i växters epigenetik

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 46 000 studenter och 8 500 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Beskrivning av ämnet

Växter har en fantastisk förmåga att reagera på miljöutmaningar genom intracellulär reglering av sina funktioner. Medan mycket fokus har legat på rollerna hos gener som kodar för proteiner, är växtgenomerna enorma och innehåller till stor del icke-kodande DNA med oklara funktionella roller för cellerna. Vår tidigare forskning har visat hur växternas icke-kodande genom bidrar till cellulära motståndskraftsmekanismer genom produktion av icke-kodande RNA-molekyler eller genom kromatinsignaturer som korrelerar med ncRNA-produktion.

Vi söker en forskare som är entusiastisk över mekanistisk växtmolekylärbiologi inom detta område. Specifikt för att ta itu med frågan om hur kromatinsignaturer kopplade till ncRNA-produktion kan hämma geninduktion. Som utgångspunkt har vi mutanter som stör denna mekanism för vidare forskning. Dessutom är en viktig aspekt av detta projekt metoder för ”Epigenome Engineering”. Dessa bygger på riktad rekrytering av histonmodifierande enzymer till platser där genrepression genom kromatinsignalering av icke-kodande fungerar.

Här kommer vi att använda NGS-kromatinmetoder (t.ex. ChIP-seq, CUT&Tag, CUT&Run) för att analysera genomomfattande såväl som riktade effekter av lokusspecifik epigenomteknik. En stark kunskap om kromatinbiologi, på bänken såväl som på datorn för dataanalys av Next-Generation Sequencing, kommer att vara till stor hjälp för projektets slutförande. Forskningsaktiviteterna i laboratoriet inkluderar också RNA-biologi, denna position fokuserar på forskningsområdet växtepigenetik (inklusive epigenomisk dataanalys). Targeted Epigenome Engineering är ett relativt nytt forskningsområde, så utbildning inom detta område lovar framtida möjligheter. Internationella forskningsbesök på samarbetande laboratorier är en möjlighet för att stärka forskarens internationella nätverk.  Det kommer att finnas en blandning av deltaganden: 1.) i pågående aktiviteter där slutförandet är relativt nära, och 2.) i initiativ med stor frihet att driva utvecklingen självständigt.

Arbetsuppgifter

Detaljerad beskrivning av arbetsuppgifterna:

• Forskning inom växtepigenetik
• Handledning av examensarbeten och doktorander
• Aktivt söka extern forskningsfinansiering
• Samarbete med näringslivet och samhället i övrigt
• Administration relaterad till de arbetsuppgifter som anges ovan
• Undervisning kan förekomma 

Kvalifikationskrav

Sökande måste ha:

• En doktorsexamen i agronomi, med expertis inom växttranskriptomik, epigenomik 
• Utmärkt förmåga att utveckla och bedriva högkvalitativ, nyfikenhetsdriven forskning
• Dokumenterad kompetens inom analys av nästa generations sekvensering
• Dokumenterad erfarenhet av analys av nästa generations sekvenseringsdata, till exempel med hjälp av högpresterande databehandling, R och Python
• Gedigen bakgrund inom molekylär växtbiologi, särskilt epigenetik
• Mycket goda muntliga och skriftliga kunskaper i engelska
• Intresse och passion för det beskrivna forskningsprojektet inom växt-epigenetik
• Kunskap om metoder för epigenomisk ingenjörskonst

Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms komplettera och stärka pågående forskning inom institutionen samt bidra till dess framtida utveckling.

Villkor mm

Det rör sig om en heltidsanställning tillsvidare som forskare. En provanställning på 6 månader kan komma att tillämpas. Tillträde 1 oktober 2026 eller enligt överenskommelse.

Kontaktperson: Sebastian Marquardt (andreas_sebastian.marquardt@biol.lu.se).

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska skrivas på engelska och innehålla:

• Meritförteckning/CV inklusive publikationslista
• En generell beskrivning av tidigare forskningsarbete och framtida forskningsintressen (max tre sidor)
• Kontaktuppgifter till minst två referenser
• Kopia av examensbevis för doktorsexamen samt ev. andra intyg/betyg som du önskar åberopa

Vid Naturvetenskapliga fakulteten bedrivs forskning och utbildning inom astronomi, biologi fysik, geovetenskap, kemi, matematik, medicinsk strålningsfysik, miljövetenskap och naturgeografi. Verksamheten bedrivs inom norra universitetsområdet. Fakulteten har ca 1 900 studenter, 330 forskarstuderande och 730 anställda.

Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.